As a megadiverse country, Mexico harbors 4 to 8% of the flora of the world and of this, 51% is endemic. There is concern because several factors are impeding its conservation. In this paper, areas of endemism for the flowering plants of Mexico are identified to prioritize regions for conservation. To categorize zones for preservation, the approach followed takes biodiversity, weighted endemism and evolutionary history into account. Lineages of angiosperms, families, genera, and formal or informal groups within genera previously retrieved as monophyletic are selected to represent evolutionary history in equivalent spatial units. A database with 9416 entries based on specimens of species belonging to 259 monophyletic groups of angiosperms from Mexico was compiled, and their presence-absence recorded for every unit area. Species richness and weighted endemism index was calculated for each of these units. The results indicate that the majority of the regions with the highest indices of endemism have a dry climate with xeric vegetation, with the exception of two areas of tropical and temperate forests. They are: the northeastern rosette scrub in Nuevo León and Coahuila, gypsum grasslands in San Luis Potosí, the Sierra Gorda in Queréraro, Tolantongo in Hidalgo, the Tehuacán-Cuicatlán Valley in Puebla and Oaxaca, El Salto in Durango, Sierra de Quila in Jalisco, a western portion of the Balsas River Basin in Michoacán, Guerrero, Morelos and State of Mexico, the Tehuantepec area in Oaxaca, the Central Depression of Chiapas and El Triunfo in Chiapas. Some of the areas of endemism in the Chihuahuan Desert, Balsas River Basin, the Central Depression of Chiapas and the southern area of Oaxaca are not sufficiently protected. Approximately 340 species were microendemic, i.e. restricted to a single quadrat, and the Cactaceae account for the majority of the species on the Mexican Red List. Key words: Cactaceae, Chihuahuan Desert, endemism, Mega-Mexico, xeric vegetation. México está considerado como uno de los países megadiversos y en su territorio se encuentran entre 4 y 8% del número de total de especies de plantas del mundo, de las cuales 51% son endémicas. Existe una gran preocupación sobre la conservación de la flora mexicana, ya que se han detectado varias actividades y factores que la amenazan. En este trabajo se identifican áreas de endemismo para las angiospermas de México con el objetivo de priorizar regiones para conservación. Para categorizar estas zonas se sigue el enfoque que toma en cuenta la biodiversidad, el índice de endemismo ponderado y la historia evolutiva. Se identificaron los linajes de angiospermas, ya sean familias, géneros, o grupos infragenéricos con o sin estatus taxonómico que previamente se habían determinado como monofiléticos para representar la historia evolutiva en unidades espaciales equivalentes. Se construyó una base de datos de 9416 registros de especies de 259 grupos monofiléticos de angiospermas restringidas a México y se registró su presencia en estas áreas. Para cada una se calculó la riqueza de taxones y el índice de endemismo ponderado. Los resultados muestran que la mayoría de las zonas de más alto endemismo están en climas secos, con vegetación xérica, con dos excepciones de vegetación tropical y templada. Los índices de endemismo ponderado más altos se localizaron en: el área norte de matorral rosetófilo en Nuevo León y Coahuila, matorrales gipsófilos en San Luis Potosí, la Sierra Gorda en Querérato, Tolantongo en Hidalgo, el Valle de Tehuacán-Cuicatlán en Puebla y Oaxaca, El Salto en Durango, la Sierra de Quila en Jalisco, la zona oeste de la Depresión del Balsas en Michoacán, Guerrero, Morelos y el Estado de México, la zona de Tehuantepec en Oaxaca y El Triunfo en Chiapas. Algunas áreas de endemismo en el Desierto Chihuahuense, en la Cuenca del Balsas y en la Depresión de Chiapas, así como del sur de Oaxaca no están suficientemente protegidas. Se registraron aproximadamente 340 especies con distribución restringida a un solo cuadrante y de éstas la mayoría de las que se incluyen en la lista de taxones amenazados de México pertenecen a las Cactaceae. Palabras clave: Cactaceae, Desierto Chihuahuense, endemismo, Mega-México, vegetación xérica.